2014-10-22 summer
在生物信息分析工作中,经常会遇到序列格式的转换,SAM格式和BAM格式的转换。所以我们需要安装samtools工作。但是在MAC下面安装和windows下面有些不同。这里我们使用brew进行安装。 具体安装步骤如下: brew tap homebrew/science brew install samtools 继续阅读 »
2014-10-30 summer
写在前面的话 本文主要记录常用的生物信息分析软件在centos操作系统上面的安装,生物信息分析的工作大部分和linux操作系统分不开,使用的很多软件也都需要在centos或其他操作系统上进行安装,本文以centos为基础进行。 软件安装列表 1、samtools 2、R 3、Blast 4、Bwa 5、Bowie Samtools 本文采用的samtools安装版本为:samtools-0.1.19.tar.bz2,如果有特殊要求请再另行下载符合需要的版本。 继续阅读 »
2015-10-31 summer
以前一直在使用ssh、ssi、guice等框架,SpringMVC也是一个比较火热的技术,一直没有实际体验过。目前在考虑某个项目的技术架构,考虑到了该技术,最近也在熟悉spring mvc方面的信息。 简介 Spring是一个开源框架,是为了解决企业应用程序开发复杂性而创建的。框架的主要优势之一就是其分层架构,分层架构允许您选择使用哪一个组件,同时为J2EE应用程序开发提供集成的框架。 继续阅读 »