多图预警！！！！
说在前面
关于Linux的历史，网络上或者书上有很多资料，简单了解就行了。在这里我主要是讲一下Linux的安装，包括虚拟机的安装，双系统的安装以及ubuntu on windows的操作。
虚拟机的安装
安装虚拟机软件
虚拟机软件有Vmware Workstation，VirtualBox等，在这里，我主要介绍使用Vmware Workstation安装过程。
首先，这里是Vmware Workstation的下载链接。
~~（正版什么的，有钱就支持，没钱就乖乖用着盗版别bb，用盗版还有优越感的话，那是你有毛病。）~~
下载完毕之后点击安装Vmware Workstation。
安装过程我想不用多说了……
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不想多说什么，直接开始主题。
JDK安装与配置
JDK下载
打开你的浏览器，不管你是Chrome还是Firefox还是Edge还是Internet Explore，只要是个浏览器就打开。
打开这个地址： http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/jdk8-downloads-2133151.html（JDK下载地址）
找到下面的地方，然后根据图片操作。
在这里根据自己系统的位数进行下载，比如我的系统是64位的就下载64位的安装包。
如果不知道怎么查看自己系统的位数，请查看这个链接：https://jingyan.baidu.com/article/0bc8
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写在前面的话
默认安装的centos操作系统，基本上都已经默认安装了perl环境，所以如果仅仅是在一台机器上使用perl语言，我们基本上不需要重新安装perl，除非你需要特定的版本或者合同规定某个特定版本。本人遇到的问题不是特定版本的需求。
真实需求：本人使用的SGE计算集群进行基因组的计算任务，计算节点都是通过管理节点安装的，整个集群顺利安装完成。针对软件的要求，需要安装相关的perl环境模块，因为计算节点有30多个，perl模块安装需要在这些节点上进行，工作量巨大，即使可以完成，后续维护和版本的升级管理也是很不方便，另外随着流程的增加perl依赖的模块也需要增加安装，这样就造成大量的重复性工作。
解决方案：因为SGE集
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首先说明一下我的安装环境：
操作系统：Win7 64位 SP1
Matlab: 2012a 64位& 2013a 64位（两个版本均试验过）
Visual Studio:2010 sp1旗舰版
下面介绍具体的安装方法：
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Windows SDK 7.1 的安装（Win 7 64bit，x64平台）
闲话少说，先准备素材。这里我已经为您准备好了一切。
Windows SDK 7.1 安装包
vs2010 sp1
VC-Compiler-KB2519277
注意：在安装VS2010时还自动安装了 Microsoft Visual C++ 2010 x86 Redistributable - 10.0.30319 及更高版本
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npm的常用命令
npm install xxx 安装模块
npm install xxx@1.1.1 安装1.1.1版本的xxx
npm install xxx -g 将模块安装到全局环境中。
npm ls 查看安装的模块及依赖
npm ls -g 查看全局安装的模块及依赖
npm uninstall xxx (-g) 卸载模块
npm cache clean 清理缓存
npm help xxx 查看帮助
npm view moudleName dependencies 查看包的依赖关系
npm view moduleNames 查看node模块的package.json文件夹
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安装
在centos操作系统安装mysql5.5，如果使用源码编译安装稍微有些麻烦，在centos中我使用简单点的方式：直接使用yum命令进行安装。
yum install mysql-server
在安装过程中会提示是否下载一些依赖，直接输入Y，等待安装完成即可。
安装完成后mysql服务默认是停止的，使用一下命令启动mysql服务。
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在网上看到的基本上都是安装完ruby后再安装ImageMagick，然后再配置环境变量就可以了。。。
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** 按照他们的安装方法经常出现缺失环境必备的文件等问题，我找了一个月左右终于找到了对应的版本：
railsinstaller-2.2.1.exe
ImageMagick-6.5.7-7-Q16-windows-dll.exe
** 我安装的文件：微云
** 然后配置四个环境变量就肯定可以安装
set DFImageMagick ImageMagick的安装目录
set PATH=%DFImageMagick%;%PATH%
set CPATH=%DFImageMagick%\include;%CPATH%
set L
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说明
本文只记录macOSX系统，其它系统参考官网
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安装
HomeBrew安装
/usr/bin/ruby -e "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install)"
brew install node
安装包
官网下载最新安装包即可
更新
HomeBrew安装的node
brew upgrade node
其它方式安装的node
使用node的包管理工具n
sudo npm cache clean -f
sudo npm install -g n
sudo n stable
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安装全局 npm 模块报 EACCES 错误的问题，例如：
$ npm install -g coffee-script
因为缺省的 npm 全局安装目录(/usr/local/node_modules)没有给当前登录用户以写权限。
当然可以在前面加上 sudo 来提升用户权限，但其实还有更好的方法
你可以通过以下三种方式的任意一种解决这个问题:
修改npm默认安装目录的权限
修改npm默认安装目录
借助第三方工具安装node，比如brew
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在上一篇《生物信息软件安装[1]》中我们已经介绍了R语言的安装，不过我们在使用R的过程中，经常会遇到使用R的其他模块，比如需要使用ggplot2包，所以我们就需要在R安装的基础上安装ggplot2包。
安装完成R之后，进入R的控制台,按照以下命令进行操作即可：
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